Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms