Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms