Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC155Q8N6L0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms