Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms