Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD2Q8IXW0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms