Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP9Q8IXQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP9Q8IXQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms