Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms