Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG1Q86XK7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms