Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms