Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms