Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRADAQ7RTN6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms