Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms