Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FGD6Q6ZV73 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms