Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms