Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRCAPQ6ZRS2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SRCAPQ6ZRS2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms