Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC73Q6ZRK6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms