Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms