Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALKAL1Q6UXT8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALKAL1Q6UXT8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms