Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP12Q6UXS9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms