Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms