Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBR1LQ6UX01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBR1LQ6UX01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms