Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms