Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms