Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms