Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms