Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHIC1Q5VXU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms