Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD4Q5VX71 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms