Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf53Q5VUE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms