Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF38BQ5VTL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms