Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRIP1Q5VSL9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms