Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFL1Q5TGJ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms