Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN11Q5T124 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN11Q5T124 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN11Q5T124 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms