Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BRMS1LQ5PSV4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms