Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms