Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms