Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms