Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A8Q2Y0W8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A8Q2Y0W8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms