Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms