Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms