Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPP1Q16831 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms