Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
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