Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK2Q16620 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK2Q16620 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK2Q16620 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NTRK2Q16620 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK2Q16620 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms