Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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