Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms