Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SSX2Q16385 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SSX2Q16385 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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