Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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