Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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