Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS72Q15906 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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