Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHHQ15465 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHHQ15465 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHHQ15465 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHHQ15465 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHHQ15465 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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