Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUM3Q15397 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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